近日，由中国生物工程学会主办，中国科学院深圳先进技术研究院、国家生物制造产业创新中心等联合承办的第四届合成生物学创新赛（SynBio Challenges）决赛在深圳举行。生化学院生物工程系主任胡升、教师赵伟睿组织学生参加本次竞赛，其中“数据哐哐队”在激烈竞争中获得“蛋白设计赛”银奖。这也是生化学子继去年首次参加该项竞赛并获得“蛋白设计赛”银奖后再次获奖。
合成生物学创新赛聚焦合成生物学领域，践行合成生物学“造物致知、造物致用”的理念。生化学生参加了“蛋白设计”赛道的比赛，他们在胡升老师和赵伟睿老师的指导下构建了一种多亚类感知型卷积编码器框架，通过在模型中引入亚类分支通道以更全面地学习不同GFP的结构特征，并采用迁移学习方法构建了融合性AI模型，提高了模型对GFP发光强度的预测准确性。在氨基酸突变序列设计中，还采用了当前最前沿的蛋白质设计工具RFdiffusion和ProteinMPNN生成了能稳定折叠的GFP蛋白质骨架及对应的氨基酸序列，提高了突变蛋白质的设计质量，为获得高发光GFP突变体创造了有利条件。最终，他们在激烈竞争中脱颖而出，与来自清华大学、南方科技大学、中国科学院大学等知名高校的16支队伍共同获得银奖。
驱动学生参加本次比赛并支撑学生获奖的《生物信息学与计算生物学》课程是面向生物工程专业“高水平创新人才培养特色班（生物智造）”学生、以培养“合成生物学”领域创新性人才而开设的“人工智能+”课程。该课程不仅介绍了与AI技术深度融合的生物信息与计算生物学前沿技术，而且注重通过实践任务驱动学生切实掌握关键技术和工具。此次获奖，不仅证明《生物信息学与计算生物学》课程在“人工智能+”教学改革研究中取得了初步成果，同时也表明生物工程专业在“人工智能+生物工程”复合型人才培养模式的创新与探索中取得了可喜进展。
